Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB4P17483 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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