Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EPCAMP16422 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms