Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL6A2P12110 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COL6A2P12110 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms