Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RGPD2P0DJD1 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms