Protein–RNA interactions for Protein: P0CG23

ZNF853, Zinc finger protein 853, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF853P0CG23 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZNF853P0CG23 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms