Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOA4P06727 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOA4P06727 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOA4P06727 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOA4P06727 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOA4P06727 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOA4P06727 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOA4P06727 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOA4P06727 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOA4P06727 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOA4P06727 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOA4P06727 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOA4P06727 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOA4P06727 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOA4P06727 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOA4P06727 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOA4P06727 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOA4P06727 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOA4P06727 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOA4P06727 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOA4P06727 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOA4P06727 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOA4P06727 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOA4P06727 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOA4P06727 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOA4P06727 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOA4P06727 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOA4P06727 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOA4P06727 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOA4P06727 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
APOA4P06727 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
APOA4P06727 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOA4P06727 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOA4P06727 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOA4P06727 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOA4P06727 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOA4P06727 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOA4P06727 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOA4P06727 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOA4P06727 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOA4P06727 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOA4P06727 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOA4P06727 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOA4P06727 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOA4P06727 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOA4P06727 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOA4P06727 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOA4P06727 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOA4P06727 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOA4P06727 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOA4P06727 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOA4P06727 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOA4P06727 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOA4P06727 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOA4P06727 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOA4P06727 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOA4P06727 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOA4P06727 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOA4P06727 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOA4P06727 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOA4P06727 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOA4P06727 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOA4P06727 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOA4P06727 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOA4P06727 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOA4P06727 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOA4P06727 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOA4P06727 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOA4P06727 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOA4P06727 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOA4P06727 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOA4P06727 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOA4P06727 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOA4P06727 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOA4P06727 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOA4P06727 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOA4P06727 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOA4P06727 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOA4P06727 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOA4P06727 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOA4P06727 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOA4P06727 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOA4P06727 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOA4P06727 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOA4P06727 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOA4P06727 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOA4P06727 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOA4P06727 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOA4P06727 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOA4P06727 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
APOA4P06727 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOA4P06727 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
APOA4P06727 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOA4P06727 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOA4P06727 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOA4P06727 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
APOA4P06727 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
APOA4P06727 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOA4P06727 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOA4P06727 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms