Protein–RNA interactions for Protein: O96018

APBA3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA3O96018 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APBA3O96018 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APBA3O96018 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
APBA3O96018 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APBA3O96018 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APBA3O96018 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APBA3O96018 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
APBA3O96018 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APBA3O96018 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APBA3O96018 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APBA3O96018 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APBA3O96018 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APBA3O96018 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APBA3O96018 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APBA3O96018 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APBA3O96018 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APBA3O96018 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APBA3O96018 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APBA3O96018 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APBA3O96018 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
APBA3O96018 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APBA3O96018 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APBA3O96018 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APBA3O96018 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
APBA3O96018 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APBA3O96018 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APBA3O96018 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APBA3O96018 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APBA3O96018 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
APBA3O96018 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APBA3O96018 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
APBA3O96018 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APBA3O96018 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
APBA3O96018 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APBA3O96018 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APBA3O96018 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APBA3O96018 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APBA3O96018 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APBA3O96018 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APBA3O96018 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APBA3O96018 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APBA3O96018 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APBA3O96018 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APBA3O96018 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APBA3O96018 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APBA3O96018 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APBA3O96018 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APBA3O96018 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APBA3O96018 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APBA3O96018 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APBA3O96018 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APBA3O96018 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APBA3O96018 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APBA3O96018 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
APBA3O96018 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
APBA3O96018 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
APBA3O96018 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APBA3O96018 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APBA3O96018 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APBA3O96018 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APBA3O96018 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APBA3O96018 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APBA3O96018 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APBA3O96018 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APBA3O96018 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APBA3O96018 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APBA3O96018 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
APBA3O96018 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APBA3O96018 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APBA3O96018 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APBA3O96018 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APBA3O96018 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APBA3O96018 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APBA3O96018 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APBA3O96018 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APBA3O96018 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APBA3O96018 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APBA3O96018 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
APBA3O96018 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
APBA3O96018 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APBA3O96018 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APBA3O96018 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APBA3O96018 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
APBA3O96018 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APBA3O96018 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APBA3O96018 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APBA3O96018 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APBA3O96018 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APBA3O96018 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APBA3O96018 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APBA3O96018 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
APBA3O96018 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APBA3O96018 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APBA3O96018 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APBA3O96018 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APBA3O96018 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APBA3O96018 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
APBA3O96018 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APBA3O96018 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APBA3O96018 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms