Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POP4O95707 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POP4O95707 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
POP4O95707 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POP4O95707 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POP4O95707 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POP4O95707 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POP4O95707 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POP4O95707 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
POP4O95707 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POP4O95707 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POP4O95707 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POP4O95707 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POP4O95707 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POP4O95707 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POP4O95707 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POP4O95707 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POP4O95707 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POP4O95707 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
POP4O95707 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POP4O95707 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
POP4O95707 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POP4O95707 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POP4O95707 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POP4O95707 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POP4O95707 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POP4O95707 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POP4O95707 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POP4O95707 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POP4O95707 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POP4O95707 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POP4O95707 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POP4O95707 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POP4O95707 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POP4O95707 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POP4O95707 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POP4O95707 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
POP4O95707 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POP4O95707 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POP4O95707 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POP4O95707 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POP4O95707 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POP4O95707 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POP4O95707 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POP4O95707 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POP4O95707 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POP4O95707 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POP4O95707 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
POP4O95707 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POP4O95707 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POP4O95707 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POP4O95707 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POP4O95707 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POP4O95707 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POP4O95707 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POP4O95707 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POP4O95707 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POP4O95707 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POP4O95707 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
POP4O95707 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
POP4O95707 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POP4O95707 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POP4O95707 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POP4O95707 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POP4O95707 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POP4O95707 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POP4O95707 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POP4O95707 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POP4O95707 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POP4O95707 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POP4O95707 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POP4O95707 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POP4O95707 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POP4O95707 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POP4O95707 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POP4O95707 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POP4O95707 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POP4O95707 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POP4O95707 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POP4O95707 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POP4O95707 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POP4O95707 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POP4O95707 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POP4O95707 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POP4O95707 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POP4O95707 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POP4O95707 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POP4O95707 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POP4O95707 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POP4O95707 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POP4O95707 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POP4O95707 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POP4O95707 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
POP4O95707 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POP4O95707 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POP4O95707 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
POP4O95707 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
POP4O95707 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POP4O95707 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POP4O95707 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms