Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CLDN9O95484 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN9O95484 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN9O95484 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN9O95484 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN9O95484 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN9O95484 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN9O95484 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN9O95484 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms