Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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