Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLGNO14967 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLGNO14967 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLGNO14967 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLGNO14967 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLGNO14967 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLGNO14967 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLGNO14967 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLGNO14967 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLGNO14967 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CLGNO14967 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLGNO14967 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLGNO14967 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLGNO14967 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLGNO14967 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLGNO14967 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLGNO14967 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLGNO14967 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CLGNO14967 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLGNO14967 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLGNO14967 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLGNO14967 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLGNO14967 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLGNO14967 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CLGNO14967 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CLGNO14967 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLGNO14967 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLGNO14967 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLGNO14967 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLGNO14967 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLGNO14967 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CLGNO14967 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLGNO14967 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLGNO14967 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CLGNO14967 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CLGNO14967 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLGNO14967 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLGNO14967 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLGNO14967 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLGNO14967 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLGNO14967 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLGNO14967 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLGNO14967 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLGNO14967 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLGNO14967 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLGNO14967 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLGNO14967 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLGNO14967 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLGNO14967 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLGNO14967 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLGNO14967 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLGNO14967 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLGNO14967 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLGNO14967 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLGNO14967 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLGNO14967 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLGNO14967 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLGNO14967 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLGNO14967 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLGNO14967 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLGNO14967 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLGNO14967 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLGNO14967 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CLGNO14967 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLGNO14967 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLGNO14967 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLGNO14967 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLGNO14967 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CLGNO14967 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLGNO14967 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLGNO14967 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLGNO14967 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLGNO14967 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLGNO14967 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLGNO14967 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLGNO14967 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLGNO14967 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLGNO14967 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLGNO14967 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLGNO14967 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLGNO14967 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLGNO14967 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLGNO14967 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLGNO14967 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLGNO14967 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLGNO14967 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLGNO14967 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLGNO14967 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLGNO14967 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLGNO14967 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLGNO14967 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLGNO14967 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLGNO14967 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLGNO14967 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLGNO14967 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLGNO14967 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLGNO14967 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLGNO14967 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLGNO14967 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLGNO14967 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms