Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms