Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y547

HSPB11, Intraflagellar transport protein 25 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB11Q9Y547 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSPB11Q9Y547 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSPB11Q9Y547 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HSPB11Q9Y547 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSPB11Q9Y547 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSPB11Q9Y547 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSPB11Q9Y547 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HSPB11Q9Y547 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HSPB11Q9Y547 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HSPB11Q9Y547 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HSPB11Q9Y547 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HSPB11Q9Y547 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.08■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HSPB11Q9Y547 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms