Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC2Q9Y235 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC2Q9Y235 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms