Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DSEQ9UL01 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms