Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBE1Q9UJT0 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms