Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATPIF1Q9UII2 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms