Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV7

MED13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13Q9UHV7 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED13Q9UHV7 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms