Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms