Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS7AQ9UBW8 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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