Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR4

VSX1, Visual system homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX1Q9NZR4 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSX1Q9NZR4 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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