Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 C3orf49-201ENST00000295896 1292 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms