Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA0

SLC22A11, Solute carrier family 22 member 11, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A11Q9NSA0 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC22A11Q9NSA0 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC22A11Q9NSA0 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC22A11Q9NSA0 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC22A11Q9NSA0 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC22A11Q9NSA0 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC22A11Q9NSA0 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC22A11Q9NSA0 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC22A11Q9NSA0 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC22A11Q9NSA0 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC22A11Q9NSA0 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC22A11Q9NSA0 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC22A11Q9NSA0 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC22A11Q9NSA0 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC22A11Q9NSA0 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC22A11Q9NSA0 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC22A11Q9NSA0 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC22A11Q9NSA0 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC22A11Q9NSA0 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC22A11Q9NSA0 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC22A11Q9NSA0 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC22A11Q9NSA0 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC22A11Q9NSA0 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC22A11Q9NSA0 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC22A11Q9NSA0 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC22A11Q9NSA0 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC22A11Q9NSA0 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC22A11Q9NSA0 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC22A11Q9NSA0 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC22A11Q9NSA0 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC22A11Q9NSA0 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC22A11Q9NSA0 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC22A11Q9NSA0 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC22A11Q9NSA0 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC22A11Q9NSA0 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC22A11Q9NSA0 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC22A11Q9NSA0 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC22A11Q9NSA0 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC22A11Q9NSA0 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC22A11Q9NSA0 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC22A11Q9NSA0 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC22A11Q9NSA0 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC22A11Q9NSA0 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLC22A11Q9NSA0 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLC22A11Q9NSA0 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC22A11Q9NSA0 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC22A11Q9NSA0 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC22A11Q9NSA0 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC22A11Q9NSA0 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC22A11Q9NSA0 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC22A11Q9NSA0 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC22A11Q9NSA0 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC22A11Q9NSA0 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC22A11Q9NSA0 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC22A11Q9NSA0 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC22A11Q9NSA0 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC22A11Q9NSA0 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC22A11Q9NSA0 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC22A11Q9NSA0 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC22A11Q9NSA0 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC22A11Q9NSA0 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC22A11Q9NSA0 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC22A11Q9NSA0 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC22A11Q9NSA0 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC22A11Q9NSA0 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC22A11Q9NSA0 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC22A11Q9NSA0 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC22A11Q9NSA0 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC22A11Q9NSA0 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC22A11Q9NSA0 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC22A11Q9NSA0 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC22A11Q9NSA0 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC22A11Q9NSA0 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC22A11Q9NSA0 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC22A11Q9NSA0 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC22A11Q9NSA0 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC22A11Q9NSA0 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC22A11Q9NSA0 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC22A11Q9NSA0 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC22A11Q9NSA0 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC22A11Q9NSA0 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC22A11Q9NSA0 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC22A11Q9NSA0 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC22A11Q9NSA0 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC22A11Q9NSA0 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC22A11Q9NSA0 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC22A11Q9NSA0 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC22A11Q9NSA0 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC22A11Q9NSA0 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC22A11Q9NSA0 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC22A11Q9NSA0 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC22A11Q9NSA0 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC22A11Q9NSA0 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC22A11Q9NSA0 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC22A11Q9NSA0 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC22A11Q9NSA0 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC22A11Q9NSA0 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC22A11Q9NSA0 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC22A11Q9NSA0 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC22A11Q9NSA0 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms