Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms