Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARFGAP3Q9NP61 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARFGAP3Q9NP61 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms