Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCC0

MCCC2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCC2Q9HCC0 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCCC2Q9HCC0 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms