Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC52A2Q9HAB3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms