Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C1

LHX5, LIM/homeobox protein Lhx5, humanhuman

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Length 402 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX5Q9H2C1 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LHX5Q9H2C1 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
LHX5Q9H2C1 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LHX5Q9H2C1 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LHX5Q9H2C1 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LHX5Q9H2C1 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LHX5Q9H2C1 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LHX5Q9H2C1 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LHX5Q9H2C1 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LHX5Q9H2C1 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LHX5Q9H2C1 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LHX5Q9H2C1 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LHX5Q9H2C1 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LHX5Q9H2C1 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LHX5Q9H2C1 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
LHX5Q9H2C1 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LHX5Q9H2C1 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
LHX5Q9H2C1 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LHX5Q9H2C1 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LHX5Q9H2C1 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LHX5Q9H2C1 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LHX5Q9H2C1 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LHX5Q9H2C1 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LHX5Q9H2C1 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
LHX5Q9H2C1 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LHX5Q9H2C1 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LHX5Q9H2C1 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LHX5Q9H2C1 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LHX5Q9H2C1 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
LHX5Q9H2C1 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LHX5Q9H2C1 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LHX5Q9H2C1 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LHX5Q9H2C1 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LHX5Q9H2C1 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LHX5Q9H2C1 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LHX5Q9H2C1 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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