Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG9

PTDSS2, Phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2Q9BVG9 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTDSS2Q9BVG9 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms