Protein–RNA interactions for Protein: Q99439

CNN2, Calponin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN2Q99439 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNN2Q99439 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNN2Q99439 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNN2Q99439 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNN2Q99439 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNN2Q99439 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNN2Q99439 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CNN2Q99439 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNN2Q99439 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNN2Q99439 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CNN2Q99439 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNN2Q99439 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNN2Q99439 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNN2Q99439 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNN2Q99439 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNN2Q99439 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNN2Q99439 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNN2Q99439 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNN2Q99439 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNN2Q99439 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNN2Q99439 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNN2Q99439 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNN2Q99439 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNN2Q99439 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNN2Q99439 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNN2Q99439 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNN2Q99439 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNN2Q99439 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNN2Q99439 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNN2Q99439 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNN2Q99439 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNN2Q99439 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNN2Q99439 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNN2Q99439 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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CNN2Q99439 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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CNN2Q99439 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CNN2Q99439 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNN2Q99439 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNN2Q99439 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNN2Q99439 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNN2Q99439 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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CNN2Q99439 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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CNN2Q99439 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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CNN2Q99439 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNN2Q99439 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNN2Q99439 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNN2Q99439 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNN2Q99439 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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CNN2Q99439 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNN2Q99439 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNN2Q99439 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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CNN2Q99439 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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CNN2Q99439 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNN2Q99439 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNN2Q99439 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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CNN2Q99439 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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CNN2Q99439 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNN2Q99439 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNN2Q99439 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNN2Q99439 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNN2Q99439 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNN2Q99439 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNN2Q99439 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNN2Q99439 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CNN2Q99439 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNN2Q99439 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNN2Q99439 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNN2Q99439 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNN2Q99439 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNN2Q99439 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNN2Q99439 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNN2Q99439 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNN2Q99439 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNN2Q99439 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNN2Q99439 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNN2Q99439 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms