Protein–RNA interactions for Protein: Q96SF2

CCT8L2, T-complex protein 1 subunit theta-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L2Q96SF2 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCT8L2Q96SF2 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms