Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CNBD2Q96M20 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms