Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAMD8Q96LT4 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAMD8Q96LT4 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAMD8Q96LT4 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAMD8Q96LT4 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAMD8Q96LT4 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAMD8Q96LT4 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAMD8Q96LT4 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAMD8Q96LT4 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAMD8Q96LT4 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAMD8Q96LT4 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAMD8Q96LT4 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAMD8Q96LT4 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAMD8Q96LT4 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAMD8Q96LT4 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAMD8Q96LT4 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAMD8Q96LT4 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAMD8Q96LT4 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAMD8Q96LT4 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAMD8Q96LT4 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAMD8Q96LT4 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAMD8Q96LT4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAMD8Q96LT4 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAMD8Q96LT4 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAMD8Q96LT4 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAMD8Q96LT4 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAMD8Q96LT4 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAMD8Q96LT4 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAMD8Q96LT4 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAMD8Q96LT4 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAMD8Q96LT4 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAMD8Q96LT4 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAMD8Q96LT4 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAMD8Q96LT4 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAMD8Q96LT4 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SAMD8Q96LT4 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAMD8Q96LT4 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAMD8Q96LT4 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAMD8Q96LT4 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAMD8Q96LT4 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAMD8Q96LT4 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAMD8Q96LT4 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAMD8Q96LT4 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAMD8Q96LT4 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAMD8Q96LT4 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAMD8Q96LT4 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAMD8Q96LT4 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAMD8Q96LT4 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SAMD8Q96LT4 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SAMD8Q96LT4 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SAMD8Q96LT4 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms