Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms