Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UTP4Q969X6 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms