Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAVIN3Q969G5 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms