Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKAP1Q86WV1 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms