Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
OTOP1Q7RTM1 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTOP1Q7RTM1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTOP1Q7RTM1 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTOP1Q7RTM1 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTOP1Q7RTM1 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
OTOP1Q7RTM1 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTOP1Q7RTM1 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTOP1Q7RTM1 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTOP1Q7RTM1 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTOP1Q7RTM1 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTOP1Q7RTM1 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTOP1Q7RTM1 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTOP1Q7RTM1 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
OTOP1Q7RTM1 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTOP1Q7RTM1 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTOP1Q7RTM1 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTOP1Q7RTM1 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTOP1Q7RTM1 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTOP1Q7RTM1 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTOP1Q7RTM1 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTOP1Q7RTM1 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
OTOP1Q7RTM1 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTOP1Q7RTM1 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTOP1Q7RTM1 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTOP1Q7RTM1 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTOP1Q7RTM1 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTOP1Q7RTM1 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTOP1Q7RTM1 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTOP1Q7RTM1 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTOP1Q7RTM1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTOP1Q7RTM1 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTOP1Q7RTM1 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
OTOP1Q7RTM1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTOP1Q7RTM1 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTOP1Q7RTM1 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTOP1Q7RTM1 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTOP1Q7RTM1 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTOP1Q7RTM1 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
OTOP1Q7RTM1 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
OTOP1Q7RTM1 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTOP1Q7RTM1 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTOP1Q7RTM1 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTOP1Q7RTM1 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTOP1Q7RTM1 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
OTOP1Q7RTM1 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTOP1Q7RTM1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
OTOP1Q7RTM1 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTOP1Q7RTM1 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTOP1Q7RTM1 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTOP1Q7RTM1 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTOP1Q7RTM1 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms