Protein–RNA interactions for Protein: Q702N8

XIRP1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP1Q702N8 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
XIRP1Q702N8 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
XIRP1Q702N8 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
XIRP1Q702N8 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
XIRP1Q702N8 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
XIRP1Q702N8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
XIRP1Q702N8 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
XIRP1Q702N8 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
XIRP1Q702N8 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
XIRP1Q702N8 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
XIRP1Q702N8 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
XIRP1Q702N8 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
XIRP1Q702N8 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
XIRP1Q702N8 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
XIRP1Q702N8 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
XIRP1Q702N8 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
XIRP1Q702N8 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
XIRP1Q702N8 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
XIRP1Q702N8 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
XIRP1Q702N8 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
XIRP1Q702N8 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
XIRP1Q702N8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
XIRP1Q702N8 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
XIRP1Q702N8 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
XIRP1Q702N8 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
XIRP1Q702N8 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
XIRP1Q702N8 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
XIRP1Q702N8 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
XIRP1Q702N8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
XIRP1Q702N8 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
XIRP1Q702N8 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
XIRP1Q702N8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
XIRP1Q702N8 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
XIRP1Q702N8 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
XIRP1Q702N8 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
XIRP1Q702N8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
XIRP1Q702N8 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
XIRP1Q702N8 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
XIRP1Q702N8 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
XIRP1Q702N8 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
XIRP1Q702N8 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
XIRP1Q702N8 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
XIRP1Q702N8 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
XIRP1Q702N8 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
XIRP1Q702N8 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
XIRP1Q702N8 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
XIRP1Q702N8 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
XIRP1Q702N8 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
XIRP1Q702N8 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
XIRP1Q702N8 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
XIRP1Q702N8 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
XIRP1Q702N8 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
XIRP1Q702N8 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
XIRP1Q702N8 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
XIRP1Q702N8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
XIRP1Q702N8 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
XIRP1Q702N8 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
XIRP1Q702N8 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
XIRP1Q702N8 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
XIRP1Q702N8 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
XIRP1Q702N8 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
XIRP1Q702N8 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
XIRP1Q702N8 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
XIRP1Q702N8 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
XIRP1Q702N8 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
XIRP1Q702N8 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
XIRP1Q702N8 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
XIRP1Q702N8 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
XIRP1Q702N8 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
XIRP1Q702N8 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
XIRP1Q702N8 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
XIRP1Q702N8 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
XIRP1Q702N8 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms