Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVM7

TOM1L2, TOM1-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1L2Q6ZVM7 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOM1L2Q6ZVM7 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms