Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms