Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGD3Q5JSP0 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FGD3Q5JSP0 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms