Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms