Protein–RNA interactions for Protein: Q17RD7

SYT16, Synaptotagmin-16, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT16Q17RD7 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT16Q17RD7 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT16Q17RD7 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT16Q17RD7 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT16Q17RD7 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT16Q17RD7 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT16Q17RD7 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT16Q17RD7 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT16Q17RD7 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT16Q17RD7 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT16Q17RD7 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT16Q17RD7 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT16Q17RD7 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT16Q17RD7 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT16Q17RD7 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT16Q17RD7 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYT16Q17RD7 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYT16Q17RD7 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYT16Q17RD7 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYT16Q17RD7 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYT16Q17RD7 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYT16Q17RD7 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYT16Q17RD7 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYT16Q17RD7 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYT16Q17RD7 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYT16Q17RD7 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYT16Q17RD7 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYT16Q17RD7 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SYT16Q17RD7 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYT16Q17RD7 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SYT16Q17RD7 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYT16Q17RD7 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYT16Q17RD7 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYT16Q17RD7 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYT16Q17RD7 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SYT16Q17RD7 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYT16Q17RD7 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYT16Q17RD7 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYT16Q17RD7 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYT16Q17RD7 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYT16Q17RD7 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYT16Q17RD7 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYT16Q17RD7 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SYT16Q17RD7 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYT16Q17RD7 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYT16Q17RD7 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYT16Q17RD7 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SYT16Q17RD7 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SYT16Q17RD7 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SYT16Q17RD7 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SYT16Q17RD7 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
SYT16Q17RD7 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SYT16Q17RD7 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SYT16Q17RD7 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SYT16Q17RD7 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SYT16Q17RD7 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SYT16Q17RD7 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SYT16Q17RD7 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT16Q17RD7 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT16Q17RD7 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT16Q17RD7 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT16Q17RD7 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT16Q17RD7 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT16Q17RD7 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT16Q17RD7 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT16Q17RD7 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT16Q17RD7 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT16Q17RD7 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT16Q17RD7 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT16Q17RD7 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT16Q17RD7 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT16Q17RD7 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT16Q17RD7 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT16Q17RD7 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT16Q17RD7 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT16Q17RD7 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT16Q17RD7 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT16Q17RD7 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT16Q17RD7 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT16Q17RD7 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT16Q17RD7 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT16Q17RD7 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT16Q17RD7 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT16Q17RD7 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT16Q17RD7 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT16Q17RD7 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT16Q17RD7 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT16Q17RD7 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT16Q17RD7 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT16Q17RD7 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT16Q17RD7 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT16Q17RD7 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT16Q17RD7 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT16Q17RD7 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT16Q17RD7 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT16Q17RD7 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT16Q17RD7 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT16Q17RD7 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT16Q17RD7 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT16Q17RD7 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms