Protein–RNA interactions for Protein: Q16566

CAMK4, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type IV, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK4Q16566 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAMK4Q16566 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAMK4Q16566 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAMK4Q16566 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAMK4Q16566 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAMK4Q16566 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAMK4Q16566 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAMK4Q16566 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAMK4Q16566 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAMK4Q16566 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAMK4Q16566 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAMK4Q16566 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAMK4Q16566 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAMK4Q16566 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAMK4Q16566 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAMK4Q16566 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAMK4Q16566 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAMK4Q16566 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAMK4Q16566 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAMK4Q16566 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAMK4Q16566 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
CAMK4Q16566 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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