Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms