Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
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SSX1Q16384 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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SSX1Q16384 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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SSX1Q16384 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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SSX1Q16384 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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SSX1Q16384 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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SSX1Q16384 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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