Protein–RNA interactions for Protein: Q16378

PRR4, Proline-rich protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR4Q16378 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms