Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
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