Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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